Τα Εργαστηριακά Κέντρα (ΕΚ) (Σχολικά Εργαστηριακά Κέντρα (ΣΕΚ)), ως εκπαιδευτικές μονάδες του ΥΠΕΠΘ έχουν αυτοτελή διοικητική δομή στην λειτουργία τους ως σχολικές μονάδες και συνεργάζονται με τα ΕΠΑΛ και τα ΙΕΚ της περιοχής τους.